1、药物悬挂法：又称挂袋法，将药物装于袋或篓内，挂于饵料台，以预防疾病发生的方法。常用于疾病发生高峰期的疾病预防。（部分处理）
优点：操作简单、用药省、对水质危害少；缺点：只能局部消毒灭菌。
2、浸洗法：放入药液中浸一段时间，苗种消毒、转池、网箱等常用。（个体处理）
优点：用药省、对水质危害少；缺点：对水体病原无作用、操作稍繁琐。
3、全池泼洒法：将药物兑成一定浓度后全池泼洒。（全员处理）
优点：对病原杀灭彻底；缺点：用药大、危害水生生物、污染环境。
4、口服法：将药物拌饵投喂。（个体处理）
优点：操作方便、可杀体内病原；缺点：重病者无效、水体病原无效。
5、涂抹法：将药物涂于伤口。 优点：药效好；缺点：操作难。（个体处理）
6、注射法：包括肌肉注射和腹腔注射。优点：药效好；缺点：操作难、易伤鱼、幼苗无法使用。